Terminologický slovník Biologických
listů
A/D
konvertor:
zařízení převádějící signály z analogové do digitální
podoby;
ABA, kyselina
abscisová (abscisic acid): kyselina
(+)‑(1´S,2Z,4E)‑5‑(1´‑hydroxy‑2´,6´,6´‑trimetyl-4´‑oxo‑2´‑cyklo‑
hexenyl)‑3‑metyl‑ 2,4‑pentadienová;
abaxiální
strana:
strana listu nebo květního orgánu odvrácená od stonku (od
středu);
ABC‑transportní proteiny (ATP‑binding
cassettes): membránové transportní proteiny, které se obecně podílejí
na přenosu širokého spektra látek (iontů, aminokyselin, cukrů, peptidů
a proteinů) přes buněčnou membránu. Je známo asi 50 transportérů,
obsahujících tzv. ATP‑vazebnou kazetu, vykazujících rozsáhlou sekvenční
homologii funkčních domén. Jejich společným znakem je využívání energie
fosfátových vazeb k exportu toxických látek
z buňky;
abnormální (defektní)
bílkoviny:
nefunkční bílkoviny vzniklé chybami při jejich syntéze nebo
poškozením;
abortívny infekčný
mechanizmus
(phage abortive infection mechanism):
mechanizmus spôsobujúci tvorbu defektných virusových
častíc;
aceruloplasminemie: choroba způsobená
nepřítomností funkčního sérového proteinu ceruloplasminu;
acetylace
histonů:
kovalentní modifikace N‑terminálních lysinů histonových molekul; připojením
acetylové skupiny na histonové oktamery v promotorových oblastech dochází ke
změně interakce molekuly histonu s DNA a ke zvýšení transkripční
kompetence;
acetylénová inhibícia
redukcie N2O: acetylén pôsobí ako
inhibítor posledného kroku denitrifikácie, redukcie N2O na N2
, intenzitu denitrifikácie možno stanoviť ako množstvo uvoľneného
N2O.
adaptace: přizpůsobení se změněným
podmínkám, např. zvýšené teplotě, která by jinak buňce škodila denaturací
bílkovin apod.;
adaxiální
strana:
strana listu nebo květního orgánu přivrácená ke stonku (ke
středu);
adventivní kořeny
(adventive roots): kořeny rostoucí na
nadzemních částech rostliny, na podzemních stoncích nebo na starých kořenech.
Zakládají se z povrchových tkání orgánu (mají exogenní
původ);
adventivní pupeny
(adventive buds): pupeny, které vyrůstají
bez spojení s apikálním meristémem z již diferencovaných tkání. Adventivní
pupeny se mouhou zakládat na stonku, kořenech a listech rostlin poměrně hluboko
v pletivu (endogenní původ) nebo v epidermis (exogenní původ). Mohou vznikat
rovněž po poranění na řízcích,kdy jsou založeny v kalusovém pletivu, které se
tvoří na ráně;
AFLP (amplification fragment length
polymorphism): technika DNA fingerprintingu, podobná RFLP, polymorfismus
restrikčních fragmentů je detegován pomocí PCR narozdíl od RFLP, kde je k tomu
využíván Southern blotting a následná hybridizace se sondou;
agamospermie
(agamospermy): produkce semen bez
oplodnění;
Ag-NOR:
barvící technika založena na použití AgNO3 detegující oblasti
sekundární konstrikce chromosomů;
agonista:
molekula schopná se specificky navázat na receptor a vyvolat stejnou odezvu jako
mediátor;
akceptorové místo
sestřihu:
(syn. pravé místo sestřihu) spojení mezi pravým koncem (3`-koncem) intronu a
levým (5`- koncem) koncem sousedního exonu;
aktinomorfní květ:
květ s více
rovinami souměrnosti;
aktivované
makrofágy:
makrofágy so zvýšenou antimikróbnou, tumoricídnou, adherečnou, fagocytárnou a
pinocytárnou aktivitou, ktorú môžu indukovať rôzne stimuly;
akumulátory (accumulators): forma odolnosti rastlín
na toxické kovy, v ktorej rastliny akumulujú vysoké koncentrácie kovov bez
akýchkoľvek toxických symptomov;
alfa‑limitný dextrín: produkt degradácie škrobu
vznikajúci účinkom α‑amylázy;
alfa-šroubovice: základní způsob skládání
proteinů, kdy aminokyseliny tvoří pravotočivou šroubovicovou strukturu
stabilizovanou vodíkovými vazbami mezi amino- a karboxylovými složkami
peptidových vazeb;
alopolyploidní
rostlina:
polyploidní rostlina, vzniklá křížením dvou různých druhů a následným
zdvojnásobením počtu chromozomů;
amastigot: bezbičíkatá životní forma
L. major;
amfifilní: mající afinitu k polárnímu i
k nepolárnímu prostředí;
amniocentesa: odběr vzorku plodové vody
z amniální dutiny punkční jehlou přes břišní stěnu;
analogová forma
signálu je představována fyzikální
veličinou, která odráží intenzitu původního optického signálu;
analogy
aminokyselin: sloučeniny strukturně
podobné aminokyselinám, které inhibující růst citlivých výchozích organismů, z
nichž se izolují regulační mutanty;
androdioecické
druhy:
druhy, u kterých se vyskytují rostliny samčí a rostliny hermafroditní;
andromonoecické
druhy:
druhy, u kterých se na jedné rostlině vytvářejí současně samčí a hermafro-ditní
květy;
aneuploidie:
přítomnost neúplných sad chromosomů v jádře buňky;
angiogenin:
protein s ribonukleasovou aktivitou, který napomáhá tvorbě cév v nádorech i v
některých dalších tkáních;
antagonista
ligandu: látka
působící protichůdně tak, že blokuje účinek ligandu navázáním ligandu nebo brání
vazbě ligandu na specifické receptory tím, že se sama na ně naváže jako
pseudoligand;
anticipace: (předjímání) možnost
předpokládat vznik postižení v následných generacích, pravděpodobnost postižení
závisí na poloze v rodokmenu;
antionkogen: gen kódující bílkovinu
potlačující vznik nádoru;
antiport:
transport látok cez membránu spoločne jedným prenášačom v protichodnom
smere;
antisense
oligonukleotidy:
krátké řetězce DNA nebo RNA komplementární k sekvencím genu nebo mRNA, které
blokují jejich aktivitu a tím zabraňují syntéze odpovídajícího
proteinu;
antisense
RNA:
nukleotidová sekvencia komplementárna k 5’‑koncu
mRNA, ktorá po hybridizácii zabráni väzbe ribozómu na iniciačný kodón, čím
zablokuje transláciu;
antisense:
antisense konstrukce je taková konstrukce transgenu, jejímž přepisem vzniká RNA,
komplementární k mRNA původního genu;
antisense-RNA: RNA komplementární pořadím
nukleotidů k mediátorové RNA; párováním nukleotidů antisense-RNA a mediátorové
RNA se znemožňuje translace a tím projev příslušného genu;
APC (anaphase promoting complex):
multiproteinový komplex účastnící se regulace buněčného cyklu, řídí ubikvitinem
zprostředkovanou proteolýzu inhibitorů anafáze a proteolýzu mitotických
cyklinů;
aph(3´)II:
gen kódující syntézu aminoglykosidfosfotransferázy;
apofytochrom (apophytochrome): fytochromový protein,
monomer bez chromoforu;
apomixie (apomixis): nepohlavní rozmnožování
(někdy je definována v užším smyslu, tak, že odpovídá
agamospermii);
apoplast: prostor vnì
buòky;
apoptosa: programovaná buněčná smrt;
apoptóza: programovaná smrť bunky,
charakteristické je štiepenie DNA a aktivácia špecifických
proteáz;
apoptóza: způsob smrti buňky, při
němž dochází k postupné řadě biologických kroků končících degradací DNA a
kondenzací případně rozpadem jádra;
apoptóza: způsob smrti buňky, při
němž dochází k postupné řadě biochemických kroků končících degradací DNA a
kondenzací případně rozpadem jádra;
AP-PCR (arbitrarily primed PCR): PCR s náhodnými
primery, polymorfismu se využívá při genetickém mapování;
aquaporiny: proteiny vytvářející
kanály, které umožňují osmotický pohyb vody přes membránu vakuoly (aquaporiny
TIP) nebo cytoplasmatickou membránu (PIP);
AR: autozomálně recesivní
dědičnost;
ARC1 (arm repeat containing
1): gen pro ARC1 s expresí pouze v blizně; při vazbě na SRK je
fosforylován. ARC1 je pozitivní efektor inkompatibilní reakce u rodu Brassica;
archegónium (zárodočník): vrecúškovité
pletivo vo vajíčku nahosemenných rastlín, v ktorom sa diferencuje samičia
gameta;
ataxie: porucha hybnosti způsobená
onemocněním nervového systému. Projevuje se nesouměrností pohybů a jejich
špatnou koordinací;
ATP-dependentní
chromatin remodelující komplexy:
multipodjednotkové proteinové komplexy, které narušují strukturu nukleosomů:
využívají energii z hydrolýzy ATP k disociaci DNA a
histonů;
atrézie:
vrozená neprůchodnost dutého orgánu;
atrofie: zmenšení normálně
vyvinutého orgánu, na němž se podílí úbytek jeho buněk nebo jejich
zmenšení;
autoimunitní
choroby:
onemocnění vyvolaná tvorbou protilátek proti vlastním
tkáním;
autológna
transplantácia: transplantácia
vlastného tkaniva, ktorá sa používa u pacientov s nádormi a niektorými typmi
leukémií. Pred liečbou sa pacientovi odoberie kostná dreň, alebo bunky
krvotvorby, ktoré sa získajú separáciou z periférnej krvi a uchovávajú sa
zmrazené, pričom ich transplantácia sa prevádza následne po absolvovaní
drastickej cytostatickej terapie;
autolýza: rozpad buňky a uvolnění
jejího obsahu do prostředí;
autolýza: rozpad buňky a uvolnění
jejího obsahu do prostředí;
autosom: jakýkoli chromosom jiný
než pohlavní;
autotrofná
denitrifikácia: disimilačná redukcia
dusičnanov alebo dusitanov autotrofnými (chemolitotrofnými) mikroorganizmami
(zdroj uhlíka - CO2, zdroj energie - jednoduché anorganické látky,
napr. elementárna síra, sirovodík, tiosíran, vodík);
auxotrofně‑regulační
mutanty (auxotrophic regulatory mutants): mutanty
dependentní na látky vyžadované k růstu a zároveň rezistentní vůči analogům
aminokyselin;
axenická
kultura:
kultura určitého organismu bez přítomnosti jiného
organismu;
B-A chromozomové
translokace: translokace èástí
chromozomù A na chromozomy B (akce-sorické), které se při meióze nerovnoměrně
rozcházejí do gamet; u kukuřice se jich užívá ke konstrukci definovaných
aneuploidů;
bar (bialaphos resistance): gen pro
rezistenci vůči herbicidům Bialaphos a Basta, v nichž je aktivní látka
fosfinothricin;
bázová
excízna oprava (base excision repair): excízna oprava,
ktorá odstraňuje modifikované bázy, apurínové, apyrimidínové miesta a
jednoreťazcové zlomy;
beta‑limitný dextrín: produkt degradácie škrobu, resp.
glykogénu vznikajúci účinkom β‑amylázy.
bezthymové myši: linie
myší, které se rodí bez thymu a proto nejsou schopné imunitních reakcí. Rostou v
nich i lidské nádorové buňky na nichž se mohou in vivo testovat protinádorové
látky;
binární
systém:
přítomnost dvou plazmidů v bakteriální buňce; jeden z nich předává část své DNA
eukaryotní buňce, druhý toto předání umožňuje;
biodegradácia: proces, ktorým nastáva
odstránenie škodlivej látky z prostredia metabolickou aktivitou prítomnej
biocenózy;
biolistika: transformace buňky
nastřelováním inertních kovových projektilů, nesoucích přenášený genetický
materiál;
biologická
denitrifikácia: disimilačná redukcia
dusičnanov alebo dusitanov výsledkom ktorej je tvorba plynných zlúčenín dusíka
NO, N2O, N2 sprevádzaná uvoľnením
energie;
bioreaktor: zariadenie využívajúce
určité druhy mikroorganizmov na zabezpečenie určitých etáp výrobného procesu
(tu: odstraňovanie dusičnanov a dusitanov z kontaminovaných vodných
zdrojov);
bioremediácia:
ozdravovanie
a regenerovanie kontaminovaného prostredia pomocou živých organiz-mov
(mikroorganizmov, nižších a vyšších rastlín);
buněčná
linie: klon
buněk vzniklý mitózou z jediné parentální buňky;
C pruhování:
barvící technika detegující zejména úseky centromerického heterochromatinu v
oblasti primární konstrikce chromosomů;
Cables (Cdk5 a Abl
substrát): prostředník interakce mezi Cdk5 a kinasou
c‑Abl;
capping enzymy: skupina enzymů
zajišťujících připojení 7‑methylguanosinové čepičky na 5´ konce
mRNA;
CAPS (cleaved amplified polymorphic
sequences): metoda založená na PCR, využívá amplifikovaných fragmentů, které
jsou štěpeny restrikčními enzymy, aby mohly být použity jako sondy
RFLP;
CAT (chloramfenicol
acetyltransferase): gen pro
chloramfenikolacetyltransferázu;
CBI (codon bias index): číselná hodnota
(0 - 1) vyjadrujúca preferenčné využívanie kodónov jednotlivých génov.
Čím je hodnota vyššia, tým je expresia príslušného génu
vyššia;
cDNA: molekula DNA vzniklá
zpětnou transkripcí RNA;
cerebellum:
mozeček;
cirkadiální
rytmy:
periodicky se vyskytující procesy; zde procesy spojené s přechodem rostlin do
reprodukčního stavu;
cirkadiánní
rytmy:
rytmy s periodou přibližně 24 hodiny;
Cockaynov
syndróm:
ľudské dedičné ochorenie spôsobené defektom v transkripčne-viazanej oprave,
prípadne v transkripcii. Pacienti predčasne starnú;
CpG ostrov: úsek DNA bohatý na CG
dinukleotidy, nachází se v promotorové oblasti genu a slouží jako regulační
oblast, regulován bývá pomocí metylace DNA a následné vazby regulačních
proteinů;
crossing-over; výměna nukleotidových
sekvencí mezi dvěma homologickými molekulami DNA probíhající zlomem a
znovuspojením;
cyklodextrín: neredukujúci cyklický dextrín,
α-cyklodextrín obsahuje šesť, β‑cyklo-dextrín sedem a g‑cyklodextrín osem glukózových
jednotiek;
cytokiny: nízkomolekulární látka,
např. interleukin, vylučované buňkami, které ovlivňují jejich
množení;
cytokiny: nízkomolekulární proteiny,
které regulují diferenciaci, proliferaci a efektorové funkce buněk imunitního
systému;
cytotoxické
bunky: rôzne lymfocyty a makrofágy, ktoré
poškodzujú alebo usmrcujú terčové bunky;
cytotoxické
buňky:
buňky usmrcující jiné buňky buď přímým kontaktem, nebo vylučovanými toxickými
produkty;
D1 protein: součást jádra fotosystému
II (PSII), která je při nadměrném ozáření poškozena;
databáze PDP: spravuje všechny vyřešené
struktury proteinů, všechna data a údaje o struktuře jsou k dispozici na adrese
http://www.rcbs.org/pdb/.
defektní myš: myš s definovaným genovým
defektem;
desenzitizace: snížení odezvy na interakci
agonisty s receptorovým vazebným místem;
desikačně ortodoxní druhy:
rostlinné
druhy, jejichž semena jsou schopna přečkat desikaci v životaschopném stavu;
desikačně rekalcitrantní
druhy:
rostlinné druhy, jejichž semena nejsou schopna přečkat desikaci v životaschopném
stavu;
diferenciace (differentiation): proces morfologických
a fyziologických změn, které provázejí vývoj buňky nezralé v buňku zralou nebo
specializovanou;
difrakce: odchylka od přímočarého
šíření vln za překážkou s rozměry srovnatelnými s její vlnovou
délkou;
digitální forma
signálu je
číselná hodnota přiřazená intenzitě signálu;
dichogamie: mechanismus zabránění
samosprášení spočívající v časově posunutém dozrávání tyčinek a
pestíků;
dimer: protein vznikl spojením
dvou polypeptidových podjednotek;
dimorfismus (dimorphism): schopnost vegetativně se
rozmnožovat alternativně v jednobuněčné či vícebuněčné (pseudohyfální či
myceliální) formě;
dispozičná
funkcia:
funkcia, relatujúca aplikovanú a vnútrobunkovú koncentráciu látky. Ako premenné
v dispozičnej funkcii vystupujú fyzikálnochemické vlastnosti látok a
biologického systému, ako aj doba expozície;
distálna časť prechodnej
zóny (distal part of the transition zone):
označovaná aj ako zóna postmitotického izodiametrického rastu, je nehomogénna
populácia buniek koreňa, ktorú charakterizuje prechod od bunkového delenia k
predlžovaniu;
doména (domain): oblasť proteínu s význačnou
terciálnou štruktúrou a charakteristickou aktivitou. Homologické domény sa môžu
vyskytovať v rôznych proteínoch;
dominancia: jav, keď príslušná alela
génu sa fenotypicky prejaví aj v heterozygótnom stave;
DOPA (3,4dihydroxyfenylalanin):
jeden z meziproduktů tvorby melaninu z aminokyseliny
tyrosinu;
dvojintróny (twintrons): intróny v intrónoch, intróny zo
skupiny II a III sa v niektorých chloroplastových génoch Euglena gracilis nachádzajú v podobe
komplexných intrónov pozostávajúcich z tzv. vnútorného a vonkajšieho
intrónu;
dvoukomponentní systém
(TCS - two-component
system): signální mechanismus využívající k přenosu signálu
fosforylací His a Asp zbytků, které jsou v nejjednodušším uspořádání součástí
dvou samostatných proteinů, mezi nimiž dochází k přenosu
signálu;
editovanie
RNA (RNA editing): proces posttranskripčnej modifikácie
spravidla len kódujúcich úsekov mRNA, výsledkom je molekula RNA, líšiaca sa
svojím sekvenčným zložením nukleotidov od matrice DNA, z ktorej bola pôvodne
prepísaná.
eikosanoidy:
produkty kaskády C20‑polyénovej kyseliny (kyselina
arachidónová);
eikozanoidy:
skupina biologicky aktívnych látok odvodená od dvadsaťuhlíkových mastných
kyselín.
eikozanoidy: skupina biologicky
aktívnych látok, ktoré vznikajú oxygenáciou niektorých dvadsať- uhlíkových
nenasýtených mastných kyselín;
endocytóza:
pohlcovanie vonkajšieho materiálu do vnútra bunky. Zahrnuje fagocytózu a
pinocytózu;
endogénna
sekrécia:
typ extracelulárnej sekrécie, pri ktorej sa sekretovaná látka akumuluje v
medzibunkových priestoroch a nevylučuje sa na povrch rastliny (na rozdiel od
exogénnej sekrécie, kedy sa sekretovaná látka dostáva von z rastliny buď priamo,
alebo do subkutikulárneho priestoru);
endomitóza: úplná nebo částečná
duplikace chromozomů v buňce, po které nenásleduje karyokineze (rozchod
chromozomů) a cytokineze (rozdělení buňky);
endonukleáza,
deoxyribonukleáza: enzym hydrolyzující DNA.
Restrikční endonukleáza je deoxyribonukleáza štěpící pouze nukleotidovou
sekvenci v dvojvláknové DNA mající dvojnásobnou symetrii kolem svého středu
(rotační symetrii);
endosperm: pletivo vzniklé druhým
oplozením specificky se vyvíjející v semeni; slouží k výživě rostlinného embrya
v průběhu zrání a klíčení;
endotoxiny: lipopolysacharidy z bunkových stien
niektorých baktérií, ktoré po injikovaní in vivo ovplyvňujú imunitu a indukujú
tvorbu protilátok;
enkapsidace (encapsidation):proces, při kterém
dochází k prostorovému uspořádání strukturních kapsidových proteinů okolo virové
nukleové kyseliny nebo při kterém je nukleová kyselina vkládána do prázdné
virové kapsidy;
enterální
výživa:
výživa pacientů aplikovaná perorálně nebo sondou, využívající resorpční
schopnosti stěny tenkého střeva při transportu živin do mimobuněčné
tekutiny;
entrainment: znovunastavení
biologických hodin podle světla;
epigenetická
změna:
změna nastávající v průběhu vývoje jedince, která je vyvolána změnou exprese
příslušného genu beze změny v jeho nukleotidové sekvenci;
epihermafroditismus: hermafroditismus navozený
prostřednictvím epimutace;
epikantus: kožní
záhyb horního očního víčka překrývající vnitřní oční
koutek;
epimutace: dědičná změna projevu
daného znaku založená na jiném principu nežli je mutace zodpovědného genu (např.
změna jeho metylačního stavu);
epitop (epitope): část
receptorového proteinu, specificky rozeznávaná určitým ligandem, který se na ni
váže;
epoxidace: adice kyslíku na dvojnou
vazbu;
ES buňka: embryonální kmenová buňka,
odvozená immortalizací buněk vnitřní buněčné masy časného embrya in vitro;
esenciálne
prvky (bioelementy): prvky,
potrebné pre zabezpečenie všetkých životne dôležitých funkcií
organizmu;
euchromatin: transkripčně aktivní
chromatin;
eukaryont:
organismus s pravým jádrem, obsahujícím chromozomy a obaleným jadernou
membránou;
eukaryotizmus
(eukaryotism): koncepcia, podľa ktorej
eukaryotická bunka predstavuje integrovaný celok viacerých funkčne
špecializovaných, priestorovo oddelených súčastí – kompartmentov. Z hľadiska
historického ide o chiméru, ktorá vznikla splynutím niekoľkých pôvodne
samostatne žijúcich prokaryotických buniek;
exina: vonkajšia sporopolenínová
vrstva steny peľového zrna so stavbou charakteristickou pre rastlinný druh,
veľmi rezistentná voči enzymatickej degradácii a
kyselinám;
exklúdery
kovov: rastliny,
ktoré účinne redukujú príjem kovov alebo zabraňujú ich vstupu do nadzem-ných
orgánov napriek vysokej koncentrácii v substráte;
exklúzia: zabránenie vstupu cudzorodej látky
(škodliviny) do cytosolu plazmatickej membrány;
export a import organelových
proteínov (export and import of organellar
proteins): systémy transportov proteínov z cytosolu do kompartmentov
(export), ako aj v rámci jednotlivých kompartmentov
(import);
expresivita: stupeň fenotypového
projevu určitého genu. Patologický gen s variabilní expresivitou může způsobit
dědičné onemocnění, které má u různých nositelů rozdílný stupeň
závažnosti;
extracelulárna
sekrécia:
sekrécia, pri ktorej sa vylučovaná látka odstraňuje zo sekrečnej
bunky;
extratermodynamická
závislosť:
termodynamická závislosť medzi biologickým parametrom a fyzikálnochemickou
vlastnosťou, nameranou v inom systéme;
faktory nekrotizujúce nádory
(TNF): majú
cytostatické a cytotoxické účinky na nádorové bunky, ale aj iné biologické
aktivity;
faradaický
signál:
proud související s oxidací nebo redukcí elektroaktivní látky (depolarizátoru)
na povrchu pracovní elektrody;
farmakofór je priestorové usporiadanie
funkčných skupín alebo častí molekuly, ktoré je nositeľom jej biologickej
aktivity;
Fc-receptory
(FcR):
väzbové miesta pre Fc-časti molekúl imunoglobulínov, ktoré sa nachádzajú na
povrchu granulocytov, monocytov, makrofágov, lymfocytov a iných
buniek;
fermentace
aminokyselin (amino acid fermentation): anabolický
proces, při kterém je aminokyselina syntetizována producentem z vhodných zdrojů
uhlíku a dusíku a v prostředí hromaděna v množstvích dostatečných pro
průmyslovou výrobu;
FISH: –
fluorescenční in situ hybridizace –
molekulárně cytogenetická metoda založená na hybridizaci fluorochomem značené
DNA či RNA sondy s cílovou sekvencí;
FISH: (fluorescent in situ
hybridization) český název!;
fotoinhibice: snížení asimilace
CO2 při nadměrném ozáření, které může být doprovázeno fotooxidativním
poškozením částí fotosyntetického aparátu;
fotoinhibícia:
inhibícia
fotosyntézy napr. fotooxidáciou;
fotoinhibícia:
inhibícia
fotosyntézy napr. fotooxidáciou;
fotokonverse
fytochromu (photoconversion): přeměna formy Pfr v
Pr, způsobená absorpcí fotonu z dlouhovlnné červené oblasti (max.730
nm);
fotomorfogenese (photomorphogenesis): soubor růstových,
vývojových a metabolických procesů a pohybových reakcí, jimiž rostlina aktivně
reaguje na světelné podmínky na stanovišti. Světelné podmínky rostliny sledují
(monitorují) pomocí specifických receptorů, zvaných
fotosenzory;
fotooxidace: oxidace
radikály obsahujícími kyslík, které vznikly v atmosféře účinkem UV
záření.
fotooxidácia:
toxický
efekt aktívnych foriem kyslíka cez oxidáciu rôznych molekúl (proteíny, lipidy
atď.),
ktorý vzniká v závislosti od svetla;
fotooxidatívny stres:
zvýšená
produkcia aktívnych foriem kyslíka v závislosti od svetla;
fotooxidatívny stres:
zvýšená
produkcia aktívnych foriem kyslíka v závislosti od svetla;
fotosenzor (photosensor): typ rostlinného
fotoreceptoru, který absorpcí fotonu přijímá informaci o světelných podmínkách
na stanovišti a zprostředkuje její přenos pro morfogenetické reakce. Fotosenzory
jsou např. fytochromy, kryptochromy a fototropin. Fotosyntetické fotoreceptory,
absorbující a přenášející energii pro fotosyntézu, nejsou
fotosenzory;
fototransformace
fytochromu (phototransformation): přeměna formy Pr
ve formu Pfr, způsobená absorpcí fotonu z krátkovlnné červené oblasti (max.
660 nm);
fototropin (phototropin): rostlinný fotosenzor,
vázaný v plasmatické membráně. Protein váže nekovalentně dvě molekuly FMN jako
chromofory. Funkčně je fototropin Ser/Thr proteinová kinasa. Fototropin
zprostředkuje signál pro fototropické reakce (pohybové reakce reflektující
pozici světelného zdroje);
fytodegradácia:
využitie
rastlín na degradáciu predovšetkým organických polutantov;
fytoextrakcia
(fytoakumulácia): príjem
a transport toxických kovov z pôdy a ich uskladnenie v kore-ňoch a
výhonkoch;
fytohormon (phytohormone): organická sloučenina
syntetizovaná rostlinou, jejíž velmi nízká vnitřní koncentrace vyvolává
fyziologickou reakci; často též označovaná jako přirozený regulátor
růstu;
fytochelatiny
(phytochelatins): peptidy se základní
strukturou (γ‑Glu‑Cys)n‑X,
(X: aminokyseliny Gly, Ala, Glu, Ser), které se aktivně účastní detoxikace
těžkých kovů především u rostlin. Fytochelatiny tvoří třídu MT‑III
v klasifikačním systému metalothioneinů;
fytochromy (phytochromes): rostlinné fotosenzory,
které zprostředkují informaci o světelných podmínkách na stanovišti pro
morfogenetické reakce rostlin. Fytochromy přinášejí mimo jiné specifické
informace o poměrech v krátkovlnné (R, red) a dlouhovlnné (FR, far-red) červené
oblasti světla. Poměr R/FR je na otevřeném prostranství blízký 1, v porostu
klesá úměrně jeho zapojení
a charakteru složení. Fytochromy jsou
chromoproteiny, funkční jsou jako homodimery. U krytosemenných rostlin se u
jednoho rostlinného druhu vyskytuje několik různých fytochromových proteinů (u
Arabidopsis např. 5). Všechny druhy
fytochromových proteinů kovalentně vážou stejný chromofor, lineární tetrapyrrol
fytochromobilin.Vyskytují se ve dvou různých fotochromických vzájemně
reversibilních formách Pr (absorbuje R) a Pfr (absorbuje
FR);
fytoremediácia:
ozdravovanie
a regenerovanie kontaminovaného prostredia pomocou
rastlín;
fytosiderofóry:
látky
(napr. kyselina mugeínová a kyselina avénová), ktoré uvoľňujú kovy naviazané na
pôdne častice a následne s nimi tvoria komplexnú zlúčeninu. Funkciu
fytosiderofórov môžu spĺňať aj chelatačné proteíny viažúce kovy, ktoré patria
medzi metalotioníny alebo fytochelatíny;
fytostabilizácia:
využitie
tolerantných rastlín na elimináciu mobility toxických kovov v pôde, a to
pro-dukciou metabolitov a následným vyzrážaním, prípadne redukciou kovu, čím sa
zabráni ďalšiemu transportu a šíreniu kontaminanta;
fytovolatilizácia:
spôsob
dekontaminácie, keď sa kontaminant transportuje z pôdy do listov, pričom sa
konvertuje na prchavé, menej toxické formy;
G pruhování:
barvící technika chromosomů založená na použití Giemsova barviva po určitém
enzymatickém zpracování preparátů;
gametický
imprinting:
gametická modifikace genu, která je závislá na pohlaví rodiče a jejímž důsledkem
je rozdíl v expresi alely zděděné od otce a od matky;
gametofyt: pohlavná generácia v
životnom cykle rastliny;
gametofytická
inkompatibilita: vzájemné působení pylu a
pestíku je kontrolováno haploidním genomem pylového zrna a diploidním genomem
tkáně pestíku. Kompatibilní i inkompatibilní pylová zrna hydratují a klíčí. Růst
inkompatibilních pylových láček je zastaven ve čnělce nebo na bliznovém
povrchu;
G‑box: promotorový element o
sekvenci CCACGTGG, k němuž se vážou transkripční faktory s bazickým leucinovým
zipem;
gene
knockout: cílené vyřazení
studovaného genu, tedy příprava nulové mutace v příslušném genu
organismu;
gene
knock‑out: vyřazení funkce genu zavedením cílené
mutace do genového lokusu za účelem poškození funkce příslušného proteinu tímto
genem
kódovaným;
gene
tagging: vnášení úseků DNA, obecně
označovaných tags (transpozony či
T‑DNA), do genomu a následná izolace přilehlých mutovaných oblastí (pomocí plasmid rescue či z genových knihoven za
použití tagu jako hybridizační
sondy);
geneta (genet): zahrnuje všechny ramety
pocházející z jedné zygoty; za předpokladu, že nedošlo k somatické mutaci je
geneticky homogenní;
genomový
imprinting:
označuje různou funkci genu ve vztahu k pohlaví podle toho, zda se dědí od otce
nebo od matky;
genová
aktivace:
modifikace gene tagging pro izolaci
genů s přirozeně nízkou či nulovou expresí, jako tag využívá T-DNA nesoucí silný
promotor nebo enhancer, po integraci
jsou přilehlé kódující sekvence transkripčně aktivovány;
glioblastom: nádor
v centrální nervové soustavě obsahující nezralé gliové
buňky;
globálna
genómová oprava (global genome repair): jedna z dráh
nukleotidovej excíznej opravy odstraňujúca široké spektrum poškodení zo všetkých
častí genómu;
glutathion (glutathione): tripeptid (γ‑Glu‑Cys‑Gly),
který je základní látkou syntézy molekul fytochelatinů. Dále se také glutathion
podílí na eliminaci volných radikálů;
glykokalyx: polysacharidový obal
mikroorganismů;
gonadoblastom:
zhoubný nádor zárodečných buněk;
gonadoliberin (GnRH - gonadotropin-releasing
hormon): hypotalamický peptidový hormon jehož funkcí je stimulace
hypofýzy k produkci gonadotropinů;
gonadotropin: glykoproteinový
hypofyzární hormon jehož funkcí je regulace steroidogeneze v pohlavních
buňkách;
gonosom: pohlavní
chromosom;
GPI‑kotvený
glykoprotein: glykoprotein kotvený volně k buněčné
membráně prostřednictvím vazby s
glykosylfosfatidylinositolem a tudíž postrádající transmembránovou část
molekuly;
gynodioecické
druhy:
druhy, u kterých se vyskytují rostliny samičí a hermafroditní;
gynomonoecické
druhy:
druhy, u kterých se na téže rostlině nacházeji současně samičí a hermafro-ditní
květy;
HECT
doména E3 ubikvitinligas:
(HECT‑homologous to E6‑AP
carboxyl terminus), jedná se o oblast proteinu obsahující
konzervativní cysteinový zbytek, ke kterému je přenesen aktivovaný ubikvitin
pomocí E2 enzymů. Uvedený cystein tvoří thioesterovou vazbu s ubikvitinem než je
ubikvitin přenesen na protein určený k degradaci. Prototypem proteinů
obsahujících oblast HECT je protein asociovaný s onkoproteinem E6 lidských
papillomavirů, který se podílí na degradaci p53;
hephaestin: multi‑Cu‑ferroxidasa,
transmembránový protein nezbytný pro přenos Fe z enterocytů do cirkulace,
nazvaný podle řeckého boha pro zpracování kovů;
hepoxilíny: biologicky aktívne
dvadsaťuhlíkové hydroxyepoxykyseliny, ktoré okrem iného vplývajú na uvoľňovanie
inzulínu (z toho pochádza ich názov);
hereditární
hemochromatosa: přetížení organismu
železem, způsobené nadměrnou absorpcí Fe z potravy v tenkém střevě a spojené s
mutací genu pro protein HFE, který zřejmě absorpci Fe
reguluje.
hermafroditní rostlinné
druhy:
druhy, u kterých jsou ve všech květech přítomny tyčinky i pestíky;
heterochromatin: transkripčně inaktivní
chromatin;
heterostylie: mechanismus zabránění
samosprášení založený na odlišné lokalizaci blizen a
prašníků;
histidinkinasa
(HK - histidine kinase): součást
dvoukomponentních systémů, kde plní funkci receptoru, proteinkinasa
fosforylující histidinové zbytky s využitím ATP jako donora
fosfátu;
histidinkinasová doména
(transmitter domain): signální doména
dvoukomponentních systémů, doména s His zbytkem schopným fosforylace, která je
zároveň schopná fosforylovat His zbytek jiné histidinkinasové domény s využitím
ATP jako donora fosfátu;
histogram
jasu
(stupňů šedi): graf zobrazující distribuci pixelů podle jasu (stupňů
šedi);
histonacetyltransferasy: enzymy, které přenášejí
acetylovou skupinu z acetyl‑koenzymu A na zbytky lysinu v N‑terminálních
oblastech histonů; tvoří svébytnou skupinu transkripčních
koaktivátorů;
histondeacetylasy: enzymy, které odstraňují
acetylové skupiny ze zbytků lysinu v N‑terminálních oblastech
histonů;
holofytochrom (holophytochrome): monomer fytochromu,
protein s chromoforem;
holoprosencefalie:
porucha rozdělení předního mozku;
homeoproteiny:
proteiny s motivem homeodomén, jejichž mRNA je kódována homeotickými geny
obsahujícími společnou sekvenci 183 nukleotidů (homeobox). Homeoproteiny jsou
jaderné proteiny, transkripční faktory, které hrají klíčovou úlohu během vývoje.
Účastní se též kontroly buněčného růstu;
homeotické
mutanty:
mutanty u kterých došlo v důsledku mutace k přeměně určitého orgánu v orgán
jiný. U rostlin byly popsány především různé přeměny květních
částí;
homeotický
gen: gen,
jehož mutace podmiňuje přeměnu jedné části těla v jinou část (např. tykadlo v
nohu u drozofily); zde se týká květních orgánů;
homologní
rekombinace:
výměna úseků DNA se stejnou nebo jen nepatrně modifikovanou
sekvencí;
Hoosteenovo
párování:
způsob párování nukleotidů, umožňující vytvořit tří a čyřřetězcové konformace
DNA;
hormon: malá molekula syntetizovaná
ve specializovaných tkáních vyšších živočichů, která řídí aktivitu jiných
specializovaných buněk;
HPt doména (histidine-containing
phosphotransfer domain): signální doména dvoukomponentních
systémů, doména obsahující histidin, která slouží k přenosu fosfátu mezi dvěma
přijímačovými doménami.
hpt, (aphIV): gen
hygromycinfosfotransferázu;
hybridizace: renaturace radioaktivní
(nebo jinak značené) sondy nukleové kyseliny k DNA nebo RNA prováděné zpravidla
pro identifikaci určitého genu nebo transkriptu;
hybridizace: spojení částečně nebo
úplně komplementárních řetězců DNA pocházejících z různých molekul DNA nebo
podobně spojení DNA řetězce s RNA řetězcem;
hyperakumulátory
kovov: rastliny,
ktoré sú schopné koncentrovať v nadzemných častiach množstvá vysoko prevyšujúce
obsah kovov v pôde alebo v neakumulujúcich rastlinách;
hypofyzace: metoda užívaná v rybářství
ke stimulaci umělého výtěru ryb injikací extraktů z rybích
hypofýz;
chaperon (z angl. - doprovod ,
garde): stresová bílkovina účastnící se transportu nově syntetizované bílkoviny
na místo určení v buňce. Stabilizuje funkční konformaci bílkoviny a umožňuje
renaturaci denaturované bílkoviny;
chondrodysplasie:
choroba vyznačující se abnormálním růstem chrupavky;
chorea: nervová porucha
spočívající v mimovolních rychlých pohybech, postihujících různé části těla -
obličej, ruce, ramena;
chorie (dispersal): šíření jedinců nebo jejich částí
větrem, živočichy ... na jiná stanoviště (např. anemochorie je šíření
větrem);
chromatin-remodelující
komplex:
multiproteinový komplex schopný modifikovat vlastnosti chromatinu, a tím
ovlivňovat genovou expresi;
chronopotenciometrická
analýza:
měření času potřebného ke změně potenciálu elektrody (dt/dE, kde T je čas a E je
potenciál) při zachování konstantního proudu v závislosti na potenciálu;
IC50: inhibičná koncentrácia
látky spôsobujúca 50 %-nú inhibíciu rastu modelového mikroorga-nizmu v
porovnaní s kontrolou bez inhibítora;
ICE‑protéáza: proteáza upravující
prekurzor interleukinu 1 na funkční molekulu (interleukin‑1 converting
enzyme);
ID50: množstvo látky, ktoré
vyvolá 50 %-nú inhibíciu enzýmovej aktivity;
imobilizácia
mikroorganizmov: adsorpcia mikroorganizmov
na povrchu nerozpustných nosičov (piesok), alebo imobilizácia primiešaním do
rôznych, spravidla vodorozpustných polymérov (alginát).
imunoglobuliny: protilátky vytvářené
B-lymfocyty v odpovědi na cizí molekulu nebo
mikroorganismus;
imunosupresívna
látka:
väčšinou bielkovina, ktorá inhibuje mitotické procesy imunitných buniek, najmä T
a B lymfocytov;
imunotoxin:
komplex toxického proteinu s protilátkou nebo jejím fragmentem namířeným proti
určitým buňkám, tkáni;
inbríding: příbuzenské křížení
vedoucí ke zvyšováni stupně homozygotnosti;
indikátory
kovov: rastliny,
pri ktorých koncentrácia kovov v pletivách odráža koncentráciu kovov v
pôde;
indukovaná
hyperakumulácia: zvýšenie
účinnosti fytoremediácie pomocou acidifikácie pôdy alebo aplikáciou chemických
zlúčenín, ktoré viažu (chelátujú) kovy, a tak zvyšujú ich príjem a translokáciu
v rastline;
induktívny
transportný systém:
systém, ktorého syntéza v rastlinách závisí od prítomnosti trans-portovanej
látky;
informozom (informosome): volná, na ribozomy
nevázaná mediátorová RNA (mRNA) v
komplexu s proteiny, mRNA ve formě tohoto ribonukleoproteinu je maskována a není
schopna translace.
inkompatibilita plazmidů
(plasmid incompatibility): neschopnost
trvalého udržení plazmidu ve společném hostitelském klonu s jiným (téže
skupiny);
inkompatibilita: mechanismus zabraňující
samosprášení na základě molekulárních interakcí mezi pylovým zrnem a
pestíkem;
integrovaná fyziologická
jednotka (integrated physiological
unit - IPU): část klonu, která je fyziologicky integrována (v rámci ní
probíhá transport zdrojů);
interleukin: heterogenní skupina
cytokinů regulujících hlavně rozličné aspekty vývoje a aktivace
leukocytů;
interleukíny: imunoregulačné polypeptidy
a glykoproteíny, ktoré produkujú makrofágy, lymfocyty, ale aj iné
bunky;
intina: pektocelulózová vnútorná
vrstva steny peľového zrna;
intron (intron): sekvencia DNA zloženého génu,
ktorého transkript sa pri posttranskripčnej úprave zostrihom vyštiepuje z
primárneho transkriptu a preto neprechádza do výslednej RNA (mRNA, rRNA alebo
tRNA);
invazivní růst (invasive growth): růst buněk do pevného
agarového média;
inzerční
mutageneze:
indukce mutace daného genu způsobená inzercí určité sekvence DNA (např.
mobilního genetického elementu);
iPCR: inverzní PCR, metoda amplifikace úseků
DNA, které jsou vně studované sekvence;
IS‑elementy (syn. IS sekvencie - IS-elements): prokaryotické transpozóny,
ktoré okrem génov kódujúcich ich transpozíciu, neobsahujú ďalšie
gény;
ischemická
kardiomyopatie: onemocnění srdeční
svaloviny způsobené vlivem nedostatku kyslíku, které může vést k jejímu
poškození až odumření;
isochromosom: chromosom,
který má obě ramena strukturně i geneticky identická;
jaderný plak (spindle pole body): mikrotubulární
organizátor u kvasinek, funkčně ekvivalentní centrosomům; několikavrstevná
diskovitá struktura integrovaná do jaderné membrány;
karyotyp: soubor chromosomů jádra
tělní (somatické buňky) charakteristický pro určitý druh
organismu;
katatoxický adaptačný
mechanizmus: adaptačný mechanizmus, pri
ktorom sa zvyšuje rezistencia odstránením stresového
faktoru;
katatoxický adaptačný
mechanizmus: adaptačný mechanizmus, pri
ktorom sa zvyšuje rezistencia odstránením stresového
faktoru;
kationtové
difúzní přenašeče (cation diffusion facilitators): nedávno
objevená rodina membránových transportérů vyskytující se u bakterií,
kvasinek, živočichů i rostlin. Jejich funkce spočívá v transportu
kovů, a to především iontů Zn2+
a Cd2+;
killer kmen: kmen produkující látku
(toxin) negativním způsobem ovlivňující kmen citlivý
(sensitivní);
kinasa II
proteinu t
- Cdk5 (cyklin dependentní kinasa 5) neboli nclk (neuronal Cdc2‑like
protein kinase);
knock-out
myši:-
laboratorní kmen, kde byl cílenou mutagenezí vyřazen studovaný
gen;
koaktivátor: pozitivní regulátor
transkripce, který aktivuje transkripci v součinnosti se sekvenčně specifickými
transkripčními faktory;
koaktivátory a korepresory
transkripce:
proteiny, které váží aktivátor (acetylasa histonů) nebo represor (deacetylasa
histonů) transkripce. Vazba k DNA je zprostředkována dalšími proteiny
(kofaktory);
kohesin (cohesin): protein udržující kohesi
chromatid, někdy označovaný jako „molekulární lepidlo“;
kolobom:
vrozený defekt nevytvoření určitých tkání, rozštěp;
kolóniotvorné jednotky
(KTJ) (colony forming units -
CFU): počet živých buniek, resp. zhlukov buniek, schopných po prenesení na
vhodné živné médium tvoriť kolónie;
komplex cytochrómov bc1: enzýmový komplex
ubichinol‑cytochróm c
oxidoreduktázy mito-chondriálneho respiračného reťazca;
komplexné plastidy
(complex plastids): plastidy, ktoré sú
obkolesené viac ako dvomi membránami (3 – Euglenophyta a Dinophyta, 4 – Heterokontophyta, Haptophyta, Eustigmatophyta, Cryptophyta, Chlorarachniophyta, Apicomplexa). Ich pôvod vysvetľuje
hypotéza o sekundárnej endosymbióze;
kongenér: ktorýkoľvek izomér
ktoréhokoľvek homológu, tj. jeden z možných substitučných derivátov
molekuly;
kongenitální:
vrozený;
konstitutivní
promotor:
promotor podmiňující stálou expresi ve všech buňkách a
orgánech;
konšpecifický: synonymné druhy majúce
rovnaké morfologické a fyziologické vlastnosti;
konštitutívny
transportný systém:
systém, ktorého syntéza je približne rovnaká bez ohľadu na prí-tomnosť
transportovanej látky;
kontig: pomyslný delší souvislý úsek klonované
DNA, obsažený v několika YAC, který je fyzikálně mapován;
konvenční nukleotidová
sekvence: (konsensus sekvence) -
ideální sekvence nukleotidů, odvozená z podobných sekvencí, vážících určitý
transkripční faktor;
konvergencia: vývoj podobných štruktúr
(orgány, molekuly atď.) pod vplyvom rozličných podmienok pri odlišných líniách
potomkov;
korepresor: negativní regulátor
transkripce, který působí v součinnosti s represorem, a to tak, že stimuluje
jeho aktivitu;
kortex (cell cortex): periferní oblast buňky pod
cytoplasmatickou membránou;
koryneformní
bakterie
(coryneform bacteria): saprofytické
bakterie, reprezentované rody Coryne-bacterium a Brevibacterium, které jsou schopny
přeměňovat glukózu z 30 až 50 % na glutamovou kyselinu. Někdy jsou proto
označovány jako bakterie produkující glutamovou kyselinu (glutamic acid producing
bacteria);
kotransport:
transport látok cez membránu spoločne, rovnakým smerom.
kryptický
promotor:
promotor, který během evoluce ztratil funkci, resp. regulovaný úsek
DNA;
kryptochromy (cryptochromes): fotosenzory, které
absorbují záření v oblasti modrého světla s přesahem do oblasti záření UV.
Zprostředkovávají informace pro růstové, vývojové a metabolické procesy,
nepřenášejí však informaci o směru dopadajícího světla. Chemicky jsou proteiny
se dvěma nekovalentně vázanými chromofory ‑ FAD a pterinem nebo deazaflavinem. V
buňce jsou lokalizovány v jádře. U krytosemenných rostlin byly dosud
identifikovány u jednoho rostlinného druhu dva kryptochromové proteiny, funkce
jsou značně redundantní;
kvazivalentní vazba
(quasiequivalent bonding):
interkapsomerní interakce, které nejsou zcela ekvivalentní, ale mírně se liší
vzdáleností a úhlem;
kyselina abscisová
(ABA):
(2‑cis, 4‑trans,
1S)‑5‑(1‑hydroxy‑2,6,6-trimethyl‑4‑oxo‑2‑cyklohexen-1‑yl)‑3‑methyl‑2,4‑pentadienová
kyselina; rostlinný hormon účastnící se regulace zrání a klíčení
semen;
lantibiotikum (lantibiotic): bakteriocín obsahujúci v
molekule štruktúru lantionínu Ala‑S‑Ala;
LCR: (ligase chain
reaction) metoda při níž dochází k opakované ligaci
oligonukleotidů na matrici, kterou může být i genomová DNA. Slouží pro detekci
bodových inzercí nebo mutací, na jejím principu je založena RED metoda detekce
délky expandovaných repetic;
LEA (late embryogenesis
abundant) proteiny: proteiny syntetizované v
maturační fázi embryogenese; nutné pro navození desikační tolerance
semen;
leukotriény: biologicky aktívne
karboxylové kyseliny s troma konjugovanými dvojitými väzbami v molekule;
lipofuscinoidní pigmenty:
koncové
produkty oxidace biologických membrán s fluorescenčními vlastnostmi podobnými
lipofuscinu
lipooxygenasy: enzymy katalyzující
oxidaci nenasycených mastných kyselin malonaldehyd:
propandial;
lipoxíny: skupina biologicky
aktívnych dvadsaťuhlíkových kyselín s troma hydroxylovými skupinami; môžu
vznikať interakciou lipoxygenázových dráh, z čoho pochádza ich názov (lipoxyge-nase interaction
products);
lipozómy: uzavreté sférické vezikuly
tvorené jednou (unilamelárne lipozómy) alebo niekoľkými dvojvrstvami lipidov
(multilamelárne lipozómy);
lokus: poloha nebo umístění
určitého genu na chromozomu;
LTR (long terminal
repeat): dlouhé koncové repetice. Sekvence DNA, charakteristické pro
retroviry a retrotransposony. Nacházejí se na obou koncích extrachromosomální
lineární dvouřetězcové DNA, vzniklé reverzní transkripcí těchto retroelementů, a
po jejím začlenění do chromosomu i na obou koncích provirové a
retrotransposonové DNA;
lyonizace: proces náhodné inaktivace
jednoho z X chromozomů u žen;
lyzigénny spôsob vzniku
sekretorickej štruktúry: pri vzniku štruktúry
dochádza k dezintegrácii buniek v mieste utvárania medzibunkového
priestoru;
MAF: faktor aktivujúci makrofágy. Je to zmes
lymfokínov vyvolávajúcich aktiváciu makrofágov. Je totožný s
interferónom-;
makromelanofory
(macromelanophores): polymorfní
pigmentové buňky o průměru 400 - 500 m u některých druhů ryb rodu
Xiphophorus;
MAP (microtubule-associated
proteins): proteiny asociované s mikrotubuly; jejich představitelem je
např. protein t, jehož hyperfosforylovaná
forma se hromadí v mozcích pacientů s Alzheimerovou
nemocí;
mapovanie
receptora
(receptor mapping): nepriama,
deduktívna charakterizácia tvaru makromolekulového väzbového miesta na základe
väzbových dát série látok, ktoré sa na receptor špecificky
viažu;
matorral
xerófilo:
typ suchomilnej vegetácie mexických púštnych oblastí s krovitým
podrastom;
medzibunkový
resp. vnútrobunkový komunikačný systém:
signálna molekula ovplyvňuje v rámci uvedeného systému funkciu vlastnej resp.
inej bunky;
melanocyty (melanocytes): finální pigmentové buňky u
ptáků a savců, diferenciační mezistupeň pigmentových buněk u ryb a
obojživelníků;
membrány na bázi tekutých
emulzí (emulsion liquid membranes): systémy
sestávající z vodných kapek, rozptýlených v organické fázi, která tvoří kulovité
útvary, dispergované v externí vodní fázi. Izolace založená na těchto systémech
umožňuje reakci substrátu s enzymem v interní vodní fázi na produkt, který se
hromadí po průchodu organickou membránou v externí vodní
fázi;
meristém: pletivo obsahující buňky
schopné dělení;
metalothioneiny
(metallothioneins): skupina peptidů
(Mr 500 ‑ 7000) s vysokým obsahem cysteinu.
Prostřednictvím sulfhydrylových skupin váží těžké i esenciální kovy
a aktivně se podílejí na buněčné metaloregulaci. Metalothioneiny jsou
rozděleny do tří tříd (MT‑I, MT‑II a MT‑III);
methylace
DNA:
kovalentní modifikace cytosinových zbytků v pozici 5 pyrimidinového kruhu;
připojením methylové skupiny k cytosinům v promotorových oblastech genů dochází
ke snížení transkripční kompetence;
metoda nejmenších
čtverců:
metoda spočívající v minimalizaci druhých mocnin odchylek; slouží k určení
parametrů regresní funkce;
microarrays: laboratorní soubory jednotlivých klonů denaturované
cDNA na mikrodestičkách, používané k identifikaci souborů mRNA z určitého
konkrétního genu;
Michaelisova
konstanta:
koncentrace substrátu, při níž je dosaženo poloviny maximální reakční
rychlosti;
mikrociny (microcins): antibiotické substance
produkované bakteriemi čeledi Enterobacteriaceae, podobné kolicinům,
ale o Mr < 10.000 Da; jsou syntetizovány ve stacionární fázi růstu
produkčních kultur;
mikrofiltrace: izolační technika
umožňující oddělit - s využitím semipermeabilních membrán - částice, jejichž
velikost kolísá v rozmezí 0,1 ‑ 10 mm;
mikromelanofory
(micromelanophores): pigmentové buňky
ryb, tvořící základní šedé zbarvení kůže; průměr 100 - 200 m;
minimálna inhibičná
koncentrácia (MIC) (minimal concentration of
inhibition): najnižšia
koncentrácia látky, ktorá spôsobuje 100 %-nú inhibíciu rastu a rozmnožovania
citlivých mikroorganizmov v porovnaní s kontrolou bez inhibítora;
minimálna mikrobicídna
koncentrácia (MMC) (minimal microbicidal
concentration): najnižšia koncentrácia látky, ktorá je schopná
usmrtiť exponovaný mikroorganizmus.
mitotický kontrolní
bod (mitotic checkpoint): kontrolní, který
dohlíží na správnou strukturu a funkci celého mitotického aparátu; je založen na
sledování interakce kinetochorů s mikrotubuly, v případě poruchy vyvolá
zablokování buněčného cyklu; jeho význam spočívá v udržení stability
genomu;
mnohonásobná
rezistencia
(mdr - multiple drug resistance,
PDR - pleiotropic drug resistance): rezistencia buniek proti
viacerým štruktúrne a funkčne odlišným toxickým látkam. Môže byť výsledkom
mutácie jediného génu alebo amplifikácie génového produktu zo siete mdr, resp. PDR génov;
mnohonásobná
rezistencia
(multiple or pleiotropic drug
resistance): rezistencia buniek proti viacerým štruktúrne a funkčne odlišným
metabolickým inhibítorom, môže byť výsledkom mutácie jediného génu alebo
nadprodukcie génového produktu niektorého zo siete génov PDR;
mnohonásobná
rezistencia
(pleiotropic or multiple drug
resistance): rezistencia buniek proti viacerým štruktúrne a funkčne odlišným
toxickým látkam, spôsobená ich efluxom z bunky. Môže byť výsledkom mutácie
jediného génu alebo nadprodukcie génového produktu niektorého z génov sietí YAP,
resp. PDR;
mobilizace
plazmidu
(plasmid mobilization): přenos kopie
nekonjugativního plazmidu do reci-pientní bakteriální buňky během konjugace
iniciované plazmidem konjugativním, současně přítomným v
donorové buňce, spolu s jeho kopií;
modifikovaný rekombinantní
protein: v
syntetickém genu upravená sekvence nukleotidů tak, aby v produkované molekule
bakteriemi Escherichia coli byl sled
aminokyselin podle záměru experimentátora;
modul (module): opakující se stavební jednotka
rostlinného těla vytvářející modulární strukturu rostlinného
těla;
monoecické
druhy:
druhy, u kterých jsou na rostlinách přítomny současně samčí a samičí
jednopohlavné květy;
monofyletický: majúci jedného spoločného
predka;
monokíny:
imunoregulátory s funkciou lokálnych hormónov sekretované makrofágmi a
monocytmi;
mononukleárový fagocytárny
systém (MFS): tvoria ho tkanivové
makrofágy, krvné monocyty a ich prekurzorové bunky v kostnej
dreni;
mucigél: sliz pokrývajúci povrch
koreňa (hlavne koreňovú čiapočku), ktorý je zložený z polysacharidov a
polygalakturónových kyselín;
multisubstrátové efluxní
systémy: (multidrug efflux systems) obecně se v
buňkách od bakterií až po člověka vyskytující, širokou ligandovou specificitou
se vyznačující, v membráně situované a bílkovinnými molekulami tvořené zařízení,
které za spotřeby buněčné energie provádí aktivní transport toxických molekul z
buňky ven;
Munc18a – protein
p67Munc18a: člen rodiny proteinů Sec1.
Má schopnost vázat se na syntaxin 1A a znemožnit interakci mezi syntaxinem 1A a
VAMP 2;
mutantní myš: myš s mutací v
genomu;
myelosupresia:
potlačenie krvotvorby v kostnej dreni, vyvolané vonkajšími faktormi
(cytostatiká, ionizujúce žiarenie, vírusová infekcia, jedy a
pod.);
myoklonie: krátké svalové
záškuby;
n‑3 MK: mastné kyseliny ktoré majú dvojitú väzbu na 3. atóme
uhlíka od metylového konca;
n‑6 MK: mastné kyseliny, ktoré majú
dvojitú väzbu na 6. atóme uhlíka z metylového konca;
náhodne amplifikovaná
polymorfná DNA (randomly amplified
polymorpfic DNA -. RAPD) modifikácia PCR, pri ktorej sa
používajú priméry ľubovolnej sekvencie a málo prísne podmienky pri reakcii
(nižšia teplota pripojenia než je optimum);
narušování (disturbance): porušení vytvořené rostlinné biomasy
např. pastvou, erozí, ohněm, ...;
nefaradaický
signál:
proud související se změnami diferenciální kapacity elektrodové dvojvrstvy v
důsledku adsorpce (desorpce) povrchově aktivních látek;
nehomologická
oprava (non-homologous end-joining repair):
spája dvojreťazcové zlomy bez potreby výraznej sekvenčnej homológie medzi
koncami DNA;
nekróza: geneticky neřízená smrt
buňky v důsledku jejího těžkého poškození vnějším zásahem;
NES: (nuclear export
signal) jaderný exportní signál je sekvence aminokyselin nezbytná pro
aktivní transport proteinu z jádra do cytoplazmy;
neuromediátor (též neurotransmiter): látka, která po
uvolnění z nervového zakončení umožňuje chemický přenos nervového signálu;
N-konec
proteinu:
proteinový řetězec má dva konce. Jeden zakončený karboxyskupinou a druhý (N -
konec) aminoskupinou;
NLS: (nuclear localisation
signal) signál pro jadernou lokalizaci.je aminokyselinová sekvence,
která zabezpečuje transport posttranslačně modifikovaného proteinu z Golgiho
aparátu do jádra, kde je tato sekvence odštěpena;
Northern
blot:
přesávka RNA;
nosná kapacita
prostředí
(carring capacity): maximální množsví jedinců sledované
populace, které je schopno existence na daném stanovišti;
npt: gen pro
neomycinfosfotransferázu;
nukleace mikrotubulů
(nucleation): proces, při kterém dochází
k zakládání struktury nových mikrotubulů na centrosomech; nukleačním místem jsou
tzv. γ‑tubulinové prstence, které usnadňují překonání kinetické bariéry pro
vznik prvního tubulinového oligomeru;
nukleosom: základní jednotka
chromatinu představující částici, která sestává z oktameru histonů
(H2A/H2B/H3/H4)2, jedné molekuly histonu H1 a úseku DNA o délce
160 ‑ 240 bp.
nukleotidová
excízna oprava (nucleotide excision repair): excízna
oprava, ktorá odstraňuje rozmanité poškodenia na fragmente DNA o dĺžke 25-30
báz;
null
myš:
mutantní myš s takovým defektem v genu, který zcela vylučuje funkci genového
produktu.
obal buněčný (cell envelope): v biologii bakteriální
buňky komplex jejích povrchových vrstev: buněčné stěny, periplazmatického
prostoru a plazmatické membrány;
oddenek
(rhizome): stonek rostoucí pod povrchem
půdy;
oktadekanoidy:
produkty kaskády C18-polyénových kyselín (kyselina linolová a
linolénová);
omega element: intron mitochondriálneho
génu špecifikujúceho 21S
rRNA
mitochondriálneho ribozómu, ktorý obsahuje ORF kódujúci proteín zodpovedný za
transpozíciu w elementu z kmeňov
w+ do w-
onkogen (oncogene): mutantní varianta
protoonkogenu, která se podílí na neoplastické
transformaci;
onkogen: gen kódující bílkovinu
stimulující přeměnu normální buňky na nádorovou;
onkonasa (onconase): ribonukleasa izolovaná z
žabích vajíček nebo ranných žabích embryí s protinádorovým
efektem;
onkosupresorový
gen (oncosuppressor gene): gen potlačující
nádorový projev;
oprava homologickou
rekombináciou (homologous recombination repair): oprava
pomocou homologickej rekombinácie, v rámci ktorej poškodený úsek DNA získa
genetickú informáciu z nepoškodeného homológu (napr. sesterskej chromatídy,
homologického chromozómu). Opravuje predovšetkým dvojreťazcové
zlomy;
oprava
chybne spárovaných báz (mismatch repair): excízna oprava, ktorá
opravuje chyby, ktoré vznikajú počas replikácie DNA chybnou inkorporáciou bázy a
chyby v heteroduplexoch po rekombinácii medzi DNA s príbuznými
sekvenciami;
ORF (open reading
frame): otevřený čtecí rámec. Úsek DNA vymezený iniciačním a
terminačním kodonem tak, že může kódovat souvislý a dostatečně dlouhý
polypeptidový řetězec;
ORF: open reading frame,
otevřený čtecí rámec;
ori místa: počátek replikace
chromozomu;
oscilátor (pacemaker): skupina buněk, která je
schopna endogenních (tj. geneticky vrozených) oscilací v tvorbě specifických
proteinů;
osteoklast (osteoclast): specializovaná mnohojaderná
buňka monocytické/makrofágové linie, která má schopnost resorbovat kostní
tkáň;
oxidatívny
stres (oxidative stress): stres vyvolaný
toxickými formami kyslíka: singletom kyslíka, superoxidovými voľnými radikálmi
(O2‑), peroxidom (O2‑) a voľnými hydroxylovými
radikálmi (OH );
oxidatívny stres:
porušený
metabolizmus kyslíka so zvýšenou produkciou jeho aktívnych foriem;
oxylipíny:
substráty lipidickej povahy podliehajúce oxidačnému
spracovaniu;
Pak1 kinasa (p21-activated kinase
1): efektor G-proteinu Rac při působení na aktinová filamenta. Pak 1
přímo reguluje polymeraci aktinu;
papilární
buňky:
protáhlé buňky, které vytváří povrch blizny;
parentální
imprinting:
aktivace nebo inaktivace genu (zejména změnou metylačního stavu DNA)
v závislosti na tom, zda byla příslušná alela vnesena do genomu potomstva
samčí nebo samičí gametou;
parietálne
postavenie:
postavenie v nád väznosti na bunkovú stenu, alebo stenu zárodočného
mieška.
PCB (polychlórované
bifenyly): skupina substitučných
derivátov bifenylu, komerčne vyrábaná jeho priamou chloráciou v prítomnosti
katalyzátora;
PC‑komplexy (PC‑complexes): fytochelatinové komplexy
dělíme na nízkomolekulární (LMW – low‑molecular
weight) vznikající v cytoplasmě a vysokomolekulární (HMW –
high‑molecular
weight) komplex vznikající ve vakuole. Vazba atomů kovů do
PC‑komplexů je základním principem jejich transportu a metabolické
inaktivace.
PCR (polymerase chain reaction): metoda
amplifikace in vitro specifikovaného
úseku DNA ohraničeného syntetickými oligonukleotidy, renaturovanými s
komplementárním vláknem;
PCR: (polymerase chain
reaction) polymerázová řetězová reakce;
penetrance: procento jedinců se
specifickým fenotypem mezi všemi nositeli genu. Gen má sníženou penetranci,
jestliže pouze část nosičů má příslušný znak nebo chorobu;
period: zkratka per, název genu biologických hodin
hmyzu;
peroxidace
lipidů:
řetězové peroxidace nenasycených mastných kyselin iniciované volnými
radikály;
petala: korunní
lístky;
pixel: element digitalizovaného
obrazu, který je charakterizován číslem odpovídajícím stupni šedi resp.
jasu;
plasmid
rescue:
vystřižení vnesené plazmidové DNA z genomu transformanta společně s přilehlými
úseky genomické DNA a její recirkulace, po transformaci bakterie takovým
plazmidem jsou charakterizovány úseky genomické DNA;
plasmid
rescue:
zpětné klonování DNA vložené do genomu v plazmidu E. coli.
plastidový faktor
(plastid factor): doposiaľ chemicky či
fyzikálne neidentifikovaný činiteľ(e) ge-nerovaný plastidmi, ktorý reguluje
expresiu v jadre lokalizovaných génov pre plastidové
proteíny;
plazmid: DNA, která není
integrována do bakteriálního chromozomu a replikuje se
samostatně;
plazmid: DNA, která není
integrována do bakteriálního chromozómu a replikuje se samostatně;
plazmidový
kointegrát:
struktura vzniklá spojením DNA dvou plazmidů.
plodolisty: listové útvary
krytosemenných rostlin, nesoucí vajíčka; srůstají v
pestík;
polutanty:
látky
prítomné v ekosystéme vo vyššej koncentrácii ako je ich prirodzená koncentrácia.
Vznikajú ľudskou činnosťou a majú škodlivé účinky na životné
prostredie;
polyény: mastné kyseliny s viac ako
dvoma dvojitými väzbami v reťazci;
polylinker:
plazmidový úsek s unikátními restrikčními místy pro několik
endonukleáz;
polynenasýtené
mastné kyseliny:
mastné kyseliny s viac ako dvoma dvojitými väzbami v
molekule;
poriny: bílkovinné molekuly tvořící
jako oligomery (nejčastěji trimery) vodou naplněné kanálky, pronikající vnější
membránou gramnegativní bakterie a umožňující průnik hydrofilních molekul
(živin) vnější membránou do periplasmového prostoru k membráně
cytoplasmatické.
presekvencia
(presequence): N‑terminálna časť jadrom‑kódovaných
organelových prekurzorov (preproteínov u chloroplastov, prepeptidov u
mitochondrií), nesúca informáciu pre transport príslušného prekurzora z cytosolu
do organely;
prietoková separácia
(flow sorting): hladký neprerušovaný
pohyb zabezpečujúci oddelovanie alebo triedenie;
primární bunìèná
stìna:
vrstva bunìèné stìny pøilehlá ke støední lamele, vytváøí se bezprostøednì po
bunìèném dìlení;
primární kořen
(primary root): kořen vyrůstající z
kořenového pólu embrya;
primární
stonek (primary stem): stonek vyrůstající ze
stonkového pólu embrya;
primárny endosymbiont
(primary endosymbiont): prokaryont v
eukaryontovi; ak sú plastidy obalené len dvomi membránami (plastidy vyšších
rastlín, zelených a červených rias, cyanoplasty glaukocystofýt), predpokladá sa,
že sú produktom primárnej endosymbiózy (pohltenie cyanobaktérie
nefotosyntetizujúcim eukaryotom);
primordium: organizovaný shluk buněk,
dávající vznik novému orgánu;
processing
(posttranslačná
úprava): proces, pri ktorom okamžite vznikajúci proteín získava svoju
oligosacharidovú „značku“ v podobe
Glc3Man9GlcNAc2 polysacharidu, ktorý sa
postupne upravuje v priebehu
vnútrobunkového transportu proteínu z lumenu ER do trans‑Golgiho
aparátu a ďalej do cieľových štruktúr bunky, alebo do mimobunkového
priestoru - sekrécia;
profesionálne
fagocyty:
leukocyty, ktoré majú vo svojej cytoplazmatickej membráne FcR. Patria sem
neutrofily, eozinofily, monocyty a makrofágy;
programovaná smrt
buňky:
geneticky řízený sled pochodů končící smrtí určité buňky;
programovaná smrt
buňky:
geneticky řízený sled pochodů končící smrtí určité buňky;
prokaryont: bakterie a aktinomycety,
jejichž genetický aparát je tvořen jediným chromozomem. Neobsahuje jadernou
membránu;
prolaps mitrální
chlopně:
drobná porucha mitrální chlopně, která se při stahu levé komory mírně vydouvá do
levé síně;
promastigot: bičíkatá životní forma L. major.
promotter
tagging: metoda izolace a
charakterizace promotorů využívá T-DNA s bezpromotorových selekčním markerem
poblíž pravé hraniční oblasti jako
tag, po integraci v blízkosti promotoru dochází k transkripci selekčního
markeru.
proofreading
aktivita:
korektorská funkce některých DNA polymeráz. Při zařazení nesprávného nukleotidu
se uplatní jejich 3`->5’exonukleázová aktivita, odštěpí se chybně
inkorporovaný nukleotid a polymerace může probíhat dál. V PCR systému to umožní
amplifikaci mnohem delších úseků DNA;
prostaglandíny: biologicky aktívne
nenasýtené karboxylové kyseliny, ktoré obsahujú vo svojej molekule
cyklopentánový kruh;
prostorové rozlišení
(spatial resolution) obrazu: množství pixelů tvořících
obraz (součin počtu pixelů v horizontální a vertikální ose
obrazu);
proteazom (proteasome, prosome, multicatalytic
proteinase complex): nelysozomální proteáza složená z více podjednotek typu
7777, značně
konzervativní v evoluci, má 5 - 6 enzymových aktivit u buněk eukaryot
a regulační úlohu v mnoha buněčných pochodech;
protein
p25
– produkt N‑koncového proteolytického štěpení p35 se zachovanou schopností
aktivovat Cdk5. Vzniká při působení stresových faktorů a ohlašuje apoptosu
neuronů;
protein
p35
- aktivátor Cdk5. Označuje se též jako nck5a (neuronal cyclin-dependent
kinase 5 activator). Spolu s proteinem p25 a proteinem 39
vytváří skupinu aktivátorů Cdk5;
protein p39 – aktivátor Cdk5 odlišný od
p35. Označuje se též jako nck5ai (neuronal cyclin- dependent
kinase 5 activator isoform).
proteinkinasy
MAPK:
proteinkinasy aktivované mitogeny. U savců existují tři hlavní skupiny MAPK,
všechny aktivované kaskádou proteinkinas. Všechny tři skupiny MAPK, ERK
(extracelulárním signálem regulovaná kinasa), p38 kinasa a JNK (c‑Jun
NH2 koncové kinasy), také známé pod názvem SAPK (stresem aktivované
MAPK), mají dvě fosforylační místa v motivech Thr‑Glu‑Tyr, Thr‑Gly‑Tyr a
Thr‑Pro‑Tyr;
proteinové
isomery:
funkčně příbuzné proteiny lišící se navzájem v primární
struktuře;
proteíny typu
ABC (ATP binding cassette
proteins): proteíny obsahujúce definované sekvencie aminokyselinových
zvyškov zodpovedných za väzbu ATP. Hydrolýza ATP u transportných proteínov je
zdrojom energie pre transport substrátu cez membránu.
proteíny typu
ABC (ATP binding cassette
proteins): proteíny obsahujúce definované sekvencie zvyškov aminokyselín,
ktoré sú zodpovedné za väzbu s ATP. Hydrolýza ATP u transportných proteínov je
zdrojom energie pre transport substrátov cez membránu;
proteíny typu
MFS (major facilitator
superfamily proteins): transportné proteíny bunkových membrán
využívajúce elektrochemický potenciál protónov ako zdroj energie pre transport
substrátov cez membrány.
proteom: soubor
proteinů, které vznikají expresí určitého genomu;
protoonkogen
(protooncogene): buněčný gen, který po
aktivaci působí jako onkogen, tj. vyvolává neoplastickou transformaci
buňky;
protoonkogen (protooncogene): strukturní gen
eukaryotické buňky, který kóduje protein podílející se na regulaci proliferace a
diferenciace;
provirus, provirová
DNA:
genomová DNA virů nebo dvouřetězcová DNA vzniklá reverzní transkripcí
retrovirové RNA začleněné do chromosomu hostitelské buňky;
PR‑proteíny (pathogenesis related):
početná a rôznorodá skupina stresových proteínov, ktoré všeobecne prispievajú k
zvýšenej odolnosti rastlín hlavne voči patogénom;
přenosová rozpouštěcí
voltametrie: postup oddělující
akumulační krok od voltametrického měření přenosem pracovní elektrody s
akumulovanou látkou z roztoku této látky do roztoku základního
elektrolytu;
přepnutí vazebné
specifity
(switching the bonding specificity):
změna konformace molekul VP1 během sebeuspořádávání polyomavirové kapsidy v
závislosti na symetricky odlišných požadavcích prostředí;
přerušený otevřený čtecí
rámec:
cílené vyřazení studovaného genu, např. vložením vhodného selekčního markeru;
příčná spojení mikrotubulů
(crossbridges): útvary vzájemně spojující
dva podélně ležící mikrotubuly; udržují trojrozměrnou strukturu mitotického
vřeténka.
přijímačová doména
(receiver domain): signální doména
dvoukomponentních systémů, doména katalyzující přenos fosfátu na svůj Asp zbytek
využívající fosfohistidinový zbytek jako donora fosfátu;
pseudobarvení (pseudocolouring): bodová úprava (point
operation) kontrastu obrazu, při které se určitému stupni šedi přiřazuje určitá
barva.
pseudohyfální růst
(pseudohyphal growth): vytváření
fragilního řetězce buněk, vznikajícího nedokonalým oddělením protáhlých buněk
při pučení;
pullulan: glukánový produkt kvasinkám
podobnej huby - Aerobacterium
pullulans; špecifický substrát pre pullulanázu;
pylový determinant/samčí
ligand:
pylový protein, pomocí kterého je bliznou rozeznáván pyl shodného S‑haplotypu. U rodu Brassica je samčím ligandem protein SCR
ze skupiny PCP;
Q pruhování:
barvící technika vyvolávající vznik světle fluoreskujících pruhů na chromosomech
po obarvení chinakrinovými sloučeninami;
QBSR (quantitative biodegradation-structure
relationships): metóda hľadajúca vzťahy medzi štruktúrou látok a ich
biodegradovateľnosťou
QSAR (quantitative
structure-activity relationships): metóda hľadajúca vzťahy
medzi chemickou štruktúrou látok a ich biologickou
aktivitou.
R: v DNA symbol pro purinovou
bázi;
rameta (ramet): jednotka, vzniklá vegetativní
multiplikací; je potenciálně fyziologicky samostatná
RAPD (random amplified polymorphic DNA):
molekulární sondování genomu na základě PCR;
RAPD (random amplified polymorphic DNA):
náhodná amplifikace polymorfní DNA, PCR technika založená na použití náhodných
GC-bohatých primerů o délce kolem 10 nukleotidů, polymorfismu se využívá při
konstrukci genetických map;
receptor: bílkovina interagující se
signálními molekulami přicházejícími z vnějšího prostředí, případně přítomnými
na povrchu jiných buněk, a přinášející informaci o jejich přítomnosti dovnitř
buňky.
receptor: je biologická makromolekula
alebo jej časť, ktorej interakcia s biologicky aktívnou látkou je zodpovedná za
príslušný biologický účinok;
receptor: vazebné místo s funkčními
vztahy; funkčními vztahy se rozumí procesy, vyvolané vazbou neuromediátoru nebo
jeho agonisty, vedoucí ke specifické fyziologické
odpovědi;
RED: (repeat expansion
detection) metoda pro vyhledávání oblastí expandovaných
trinukleotidových repetic. V LCR reakci jsou ligovány oligonukleotidy dané
sekvence tehdy, jestliže se vážou do ekvivalentně dlouhého řetězce temlátové
DNA. Takto je generována řada produktů, jejichž maximální délka koresponduje s
délkou zkoumané oblasti v genomu;
reduktázy: enzýmy katalyzujúce
postupnú redukciu dusičnanov na plynný dusík, pomenované podľa substrátu
redukciu ktorého katalyzujú: nitrátreduktáza, nitritreduktáza, NO-reduktáza,
N2O-reduktáza;
redundantná DNA
(redundant DNA, repetitive DNA sequence):
rovnaká sekvencia DNA niekoľkonásobne opakovaná v haploidnom
genóme;
regrese: proložení spojité křivky
(přímky) mezi experimentálně naměřenými body s ohledem pouze na odchylky v
souřadnici y;
regulace snížením počtu
receptorů (down-regulace): snížení počtu receptorových vazebných
míst pro agonisty;
regulační
mutanty (regulatory mutants) jsou mutanty
rezistentní vůči analogům aminokyselin, které mají klíčový enzym biosyntézy
uvolněný z působení regulačního mechanismu;
regulátor odpovědi
(RR - response regulator):
součást dvoukomponentních systémů, kde zajišťuje odpověď na působení signálu,
protein, jehož výstupní doména, případně výstupní aktivita, je regulována
přijímačovou doménou;
rekombinantní
molekula:
proteinová molekula připravená pomocí syntetického genu vloženého do kultury Escherichia coli a těmito bakteriemi
produkovaná;
remediácia:
ozdravovanie
a regenerovanie kontaminovaného prostredia;
reprodukční kapacita
(reproductive capacity): průměrný počet semen vyprodukovaných
jednou rostlinou za jeden rok;
reprodukční síla
(reproductive effort): podíl čisté primární produkce
věnovaný na generativní reprodukci;
retroviry (retroviruses): viry charakteristické
zpětnou (reverzní) transkripcí. Genomem infekční částice je + řetězec RNA,
virová reprodukce začíná obráceným přepisem z RNA do DNA pomocí virového enzymu
reverzní transkriptázy.
reversní
genetika:
využívá opačného postupu při studiu dědičnosti znaků než klasická genetika,
postupuje od známé sekvence genu k jeho fenotypovému
projevu;
reverzní
sestřih (reverse splicing): včlenění RNA kopie
intronu do jiné RNA neobsahující tento intron;
reverzní
transkripce: přepsání genetické
informace z RNA do DNA;
reverzní
transkriptasa: DNA polymerasa
katalyzující přepis genetické informace z RNA do DNA;
RFLP (restriction fragment length
polymorphism): délkový polymorfismus restrikčních fragmentů, využití při
konstrukci genetických map, genomová DNA se po štěpení restrikčními
endonukleázami a po separaci fragmentů gelovou elektroforézou přenese na
membránu (Southern blotting) a potom hybridizuje se sondou komplementární k
určitému lokusu.
RFLP (restriction fragment
length polymorphism):
metoda rozlišování různých druhů nebo variet organismů či jejich hybridů na
základě rozdílné délky určitých restrikčních fragmentů jejich
DNA.
RGG box: několik opakování
tripeptidu RGG (Arg.Gly.Gly), motiv odpovědný za vazbu
RNA;
ribonukleasový
inhibitor:
proteinová látka, která inhibuje funkci dané ribonukleasy v buněčném
cytosolu;
ribonukleasy:
enzymy bakterií, rostlin a zvířat, které štěpí ribonukleové kyseliny a tím
ovlivňují jejich množství a funkci v buňkách;
ribotypizácia (ribotyping): metóda na typizáciu
bakteriálnych kmeňov založená na hybridizácii reštrikčných frgmentov genómovej
DNA s DNA sondou, ktorá kóduje rRNA;
ribozym: katalytická molekula RNA;
katalyzuje štěpení, ligaci a přenos krátkých molekul RNA i bez přítomnosti
proteinů; má schopnost samoreplikace;
ribozým:
sekvenčná doména RNA s katalytickou funkciou, ktorá sa využíva experimentálne na
štiepenie molekúl RNA v špecifických sekvenciách;
rizofiltrácia:
absorpcia
a koncentrovanie toxických kovov z kontaminovaných vodných tokov pomocou
koreňového systému rastlín;
ró° kmen: kmen neobsahující
mitochondriální DNA.
rodičovská
molekula
(parent, lead compound): je molekula
s biologickou aktivitou požadovaného typu. Obmenami jej štruktúry sa hľadajú
biologicky účinnejšie molekuly.
rozpouštěcí (stripping) voltametrie: elektroanalytická metoda
zahrnující akumulaci stanovované látky na povrchu pracovní elektrody (ve formě
amalgamu nerozpustné soli nebo adsorbované vrstvy) a následné měření proudové
odezvy elektrody v závislosti na potenciálu;
RT-PCR: metoda PCR, kde prvním
krokem je přepis templátové RNA reversní transkriptázou do DNA, následuje
klasická PCR;
sacculus: z latinského sáček - značí topologicky
uzavřený váček, v tomto případě strukturu tvořenou peptidoglykanovou
síťovinou;
saturační
práh (saturation threshold) senzoru: odpovídá maximu jasu, jehož
další zvýšení již nezpůsobí další zvýšení analogové resp. digitální formy
signálu;
sekundárna endosymbióza
(secondary endosymbiosis): eukaryont v
eukaryontovi - hypotéza
vy-svetľujúca pôvod komplexných plastidov (sú uzatvorené viac ako dvomi
membránami – 3 a 4). Z fotosyntetizujúceho eukaryonta (riasy), ktorý bol
pohltený heterotrofným eukaryotickým fagotrofom, zostali okrem plastidu
zachované len nadbytočné membrány obklopujúce pôvodne dvojmembránovú
organelu.
sekundární atmosférické
polutanty (secondary air pollutants): polutanty
vzniklé z polutantů primárních (původních imisí) v atmosféře oxidací či jinými
reakcemi;
sekundární bunìèná
stìna:
vrstvy bunìèné stìny vznikající druhotným tloustnutím v prùbìhu diferenciace
buòky;
sekurin (securin): inhibitor separinu neboli
protein, který až do anafáze brání separaci chromatid;
selektovaný
gen: buňky,
pletiva a celé organismy, u nichž dochází k expresi tohoto transgenu, lze
pozitivně selektovat na základě rezistence vůči antibiotiku, herbicidu nebo jiné
toxické látce;
selektovateľný
znak (selectable marker): gén vo vektore
(plazmide), ktorý po expresii dovoľuje identifikovať transformantov medzi
netransformovanými bunkami hostiteľského kmeňa. Umožňuje pozitívne selektovať
transformanty na základe prototrofie alebo rezistencie buniek proti antibiotikám
alebo iným toxickým látkam.
seminální ribonukleasa:
RNasa
přítomná v semenné plasmě některých zvířat (včetně člověka). Má imunosupresivní
charakter a chrání spermie v samčích i samičích pohlavních orgánech proti
imunologickému poškození. Rozkládá také zbytky RNA na
spermiích.
senescence: konečná fáze
stárnutí;
sepala: kališní
lístky;
separin (separin): proteasa provádějící degradaci
kohesinu.
sesterské
druhy:
blízko príbuzné druhy, ktoré boli len nedávno geneticky izolované jeden od
druhého (definícia zo základných učebníc genetiky). Kurtzman považuje druhy s
počtom substitúcií menším ako 1 %,
za sesterské (Kurtzman a Robnett 1998);
schizogénny spôsob vzniku
sekretorickej štruktúry: spôsob diferenciácie
sekretorickej štruktúry, pri ktorom medzibunkový priestor vzniká separáciou
bunkových stien susedných buniek;
signálna hypotéza
(signal hypothesis): predpoklad, že
efektívnosť transportu proteínov do kompartmentov je daná vlastnosťami
odštiepiteľného signálu presekvencie, ktoré samé nesú.
signálna
transdukcia:
prenos signálu na úrovni bunkovej membrány;
signálna
transmisia:
prenos signálu na úrovni cytozolu.
signální
transducer:
mezinárodně používaný termín pro obecně se vyskytující molekulárně specifický
dvousložkový systém situovaný v cytoplasmatické membráně, kterým obecně buňka
vnímá chemické signály z okolí a podle nich moduluje genovou expresi. Konkrétní
transducer se skládá z enzymově aktivní molekuly - sensoru (kinasa), který
interaguje se signálním ligandem, a z regulační molekuly, která chemicky
modifikována (fosforylována) aktivovaným sensorem se váže na DNA a moduluje
transkripci (expresi genu).
sink (sink): část rostliny, která importuje
asimiláty z místa jejich vzniku (ze zdroje);
skotomorfogenese (scotomorphogenesis): soubor růstových a
vývojových reakcí, které u rostlin probíhají ve tmě.
S‑lokus:
jednoduchý multialelický lokus s mendelistickou dědičností dlouhý několik
desítek kilobasí. Obsahuje geny SLG, SRK a SCR, které kosegregují přesně s AI
fenotypem.
SNAP‑25 (synaptosome-associated
protein o Mr 25 000): t‑SNARE protein presynaptické membrány
nutný pro vazbu v-SNARE presynaptických měchýřků a sekreci
neuromediátorů;
spasticita: zvýšené napětí
svalů;
spinální: týkající se
míchy;
sporofytická
inkompatibilita: S specifita pylového zrna
je určena S alelami, které jsou přítomné v pylu donorové rostliny. Vzájemný
vztah mezi alelami v pestíku i v prašníku je dominantně recesivní. Pro
sporofytický systém je charakteristická rychlá inhibice klíčení inkompatibilního
pylu nebo dojde k růstu pylové láčky, která se pak nachází v prostoru mezi pylem
a bliznou;
SSLP (simple sequence length polymorphism):
metoda zjišťování heterogenity mikrosatelitů pomocí PCR;
standardní fenotyp
(wild – type phenotype): projev
standardní alely ve fenotypu.
støední
lamela:
vrstva bunìèné stìny vznikající pøi bunìèném dìlení splynutím mìchýøkù Golgiho
aparátu;
stolon
(stolone): nadzemní plagiotropní
stonek;
strabismus:
šilhání;
stres (stress): dlouhodobější negativní vliv, který
způsobuje snížení produkce;
stres: dlouhodobé působení
nepříznivých faktorů na buňku;
striatum: část bazálních ganglií,
obsahuje můstky, kudy procházejí neurony, ležící v kortexu a zasahující svými
axony do míchy;
striktně dioecické
druhy:
druhy, u kterých nese rostlina bud samčí nebo samičí květy
sukcese vegetace
(succesion of vegetation): vývojový sled a postupné změny
porostů na stanovišti;
súrodenecké druhy:
jednoznačne
odlišné druhy (podľa Dobzhanského kritéria) s veľmi príbuznými sekvenciami
(napr. S. paradoxus a S. cerevisiae Naumov 1996,
obr.1,2). Tento pojem často splýva s termínom sesterské.
symplast: vnitrobuněčný prostor,
ohraničený plazmatickou membránou;
synchronizátory: faktory vnějšího
prostředí, které synchronizují biologické hodiny s vnějším 24 h dnem.
Hlavním synchronizátorem je světlo, tj. střídání světla a
tmy;
Syntaxin 1A: t‑SNARE protein
presynaptické membrány nutný pro vazbu v‑SNARE presympatických měchýřků a
sekreci mediátorů;
syntoxický adaptačný
mechanizmus: adaptačný mechanizmus, pri
ktorom sa zvyšuje rezistencia bez odstránenia stresového faktoru.
syntoxický adaptačný
mechanizmus: adaptačný mechanizmus, pri
ktorom sa zvyšuje rezistencia bez odstránenia stresového faktoru.
šok: náhlé vystavení buňky
nepříznivým podmínkám.
tapetum:
pletivo specificky se vyvíjející v prašníku; slouží k výživě pylového zrna v
průběhu jeho zrání.
tapetum: vnútorná výstelková vrstva
steny peľnice, poskytujúca nutričné, regulačné a stavebné látky vyvíjajúcemu sa
peľu.
TAS (telomere associated
sequences): sekvence DNA, které se na chromozomu nacházejí
bezprostředně za telomerovými repeticemi;
taxón: klasifikačná trieda v
taxonómii;
ťažké
kovy: kovy
so špecifickou hmotnosťou väčšou ako 5 g cm-3;
T-DNA
mutageneze:
indukce mutací včleňováním T-DNA do genových sekvencí rostlinného
genomu;
těkavé chlorované
uhlovodíky
(volatile
chlorinated hydrocarbons): v
článku jsou vesměs míněny chlorderiváty
C2‑uhlovodíků tri- a tetrachlorethen a 1,1,1‑trichlorethan pokud není
uvedeno jinak;
telobox: konzervativní sekvence
aminokyselin nacházející se v proteinech, jež se vážou k telomerovým
repeticím;
temnostní reverse
fytochromu (dark reversion): spontánní přeměna formy
Pfr v Pr bez absorpce fotonu (probíhá i ve tmě).
terč kolicinu letální
(colicin lethal target): molekulární
struktura v buňce, jejíž zásah kolicinem způsobí její
usmrcení.
terčové
bunky:
rôzne typy buniek, ktoré sa stali terčom pôsobenia bunkových a molekulových
mechanizmov špecifickej i nešpecifickej imunity;
timeless: zkratka tim, název genu biologických hodin
hmyzu.
tmavý práh (dark threshold) senzoru: odpovídá dolní hranici jasu,
který lze ještě zaznamenat senzorem;
topogenické sekvencie
(topogenic sequences): sekvencie
prekurzorov proteínov, ktoré sú zodpovedné za ich adekvátnu topológiu v membráne
endoplazmatického retikula a/alebo transportných vezikúl.
toxické
kovy: kovy
(antropogénneho pôvodu alebo prirodzeného pôvodu, avšak vo vyššej koncentrácii
ako je optimálna) majúce toxické účinky;
transaktivace: aktivace transkripce genů
prostřednictvím specifických regulačních proteinů;
transenkapsidace: enkapsulace viru do
plášťového proteinu jiného viru.
transformace
(transformation): přeměna somatické buňky
v buňku nádorovou.
transformace
souřadnic:
zavedení nové soustavy souřadnic, které jsou k původní soustavě vázány
matematickými vztahy.
transformácia
buniek:
premena vlastností a morfológie buniek. Transformáciou sa menia zvyčajne
normálne bunky na nádorové bunky.
trans-gauche
konformace:
označení tvaru uhlovodíkových řetězců v molekulách fosfolipidů;
v konformaci trans leží vazba
C-C v rovině dvou předcházejících vazeb C‑C; konformace gauche vzniká rotací uvažované vazby
kolem osy předcházející vazby o 120.
transgenose: přenos klonovaného genu do
eukaryotického genomu.
transglykozylácia: typ chemickej reakcie, pri ktorej
dochádza k štiepeniu substrátu a zároveň prenosu zvyšku pôvodného
substrátu do inej, novej polohy;
transkripčne-viazaná
oprava (transcription-coupled repair):
zabezpečuje rýchle a účinné odstránenie poškodení blokujúcich elongáciu
transkripcie RNA polymerázou II, t.j. opravuje transkripčne aktívne oblasti
genómu;
transkripční faktory:
proteiny
specificky se vážící k DNA, regulují transkripci;
transkripčný
faktor:
akýkoľvek proteín, iný ako RNA-polymeráza, ktorý je potrebný pre iniciáciu alebo
reguláciu transkripcie v eukaryotických bunkách. Špecifické transkripčné
faktory, na rozdiel od všeobecných, stimulujú (alebo potláčajú) transkripciu
určitých génov väzbou na ich regulačné sekvencie;
transkriptom:
soubor molekul mRNA, které vznikají transkripcí určitého
genomu.
translační
produkt:
právě syntetizovaná bílkovina se signálním peptidem na N konci, dosud
postranslačně nemodifikovaná;
translokace: vzájemná výměna částí
nehomologních chromozomů.
transportér: membránový transportný
proteín zodpovedný za pohyb rôznych iónov a molekúl cez
membránu.
tranzitný peptid
(transit peptide): dodnes najpoužívanejší
termín pre N‑terminálne časti preproteínov chloroplastov zodpovedné za ich
translokáciu z cytosolu cez membrány chloroplastu až na miesto ich funkčnej
lokalizácie. Tranzitný peptid je do istej miery synonymom presekvencie, či
historicky starších termínov: zacieľovacia sekvencia (targeting sequence), tranzitná sekvencia (transit sequence), signálna sekvencia (signal sequence);
TRAP reakce (telomerase repeat
amplification protocol): velice citlivá metoda detekce
telomerázové aktivity. Sestává se ze dvou kroků: v prvním kroku dochází k
prodlužování netelomerového oligonukleotidu telomerázou a v druhém kroku se
vzniklé produkty amplifikují pomocí PCR;
triangulační číslo T
(triangulation number T); celé kladné
číslo popisující ikosahedrální symetrii virových částic. Název je odvozen ze
způsobu, jakým lze rozdělit povrch ikosahedrální částice na menší trojúhelníky a
vytvořit tak ikosahedrální povrchovou mříž. Je definováno výrazem T = h2 + hk + k2, kde h a k jsou celá čísla představující indexy
shodné svým směrem a smyslem s vektory triangulární sítě.
TRIP: (TRInucleotide binding
protein) ssDNA vazebné proteiny, rozeznávající sekvenci nejméně 8
stejných tripletů struktury R.R.Y;
trisomie:
přítomnost tří totožných chromosomů v buněčném jádře;
tromboxány: skupina nenasýtených
karboxylových kyselín, pre ktoré je charakteristická prítomnosť
tetrahydropyránového (oxánového) kruhu.
t‑SNARE (target SNAP receptors;
SNAP = soluble N-ethylmaleimide‑sensitive factor attachment
protein): membránové proteiny cílových membrán cytoplasmatického
vesikulárního transportu určené pro vazbu v-SNARE, umožňující splynutí
cytoplasmatických transportních měchýřků s cílovými
membránami;
ubikvitín:
vysoko konzervatívny eukaryotický proteín, pozostávajúci zo 76 aminokyselinových
zvyškov, ktorého reťazce sa kovalentne viažu na bielkovinu, určenú k
proteolytickej degradácii.
ultrafiltrace: izolační technika na bázi
semipermeabilních membrán, jíž lze oddělit částice a makromolekuly o velikosti
0,001 mm.
uniparentální
disomie:
zdědění obou homologních chromosomů od jednoho rodiče.
unipolární pučení
(unipolar budding): nové pupeny se tvoří
na pólu buňky opačném k pólu, kde se buňka oddělila od
mateřské.
UTR (untranslated
region): úsek DNA, který se přepisuje do RNA, avšak nepodléhá
translaci.
UTR: (untranslated region)
nepřekládaná oblast genu tj. oblast, lokalizovaná na okraji genu před
startovacím nebo za terminačním kodonem;
VAMP 2 (vesicle-associated
membrane protein 2) neboli synaptobrevin: pomocí tohoto
v‑SNARE proteinu rozpoznávají synaptické měchýřky cílové t-SNARE proteiny v
presynaptické membráně;
vegetativní multiplikace
(vegetative multiplication): druh
nepohlavního rozmnožování, které se uskutečňuje vegetativním růstem a následným
rozpadem mateřské rostliny na více dceřiných rostlin.
violaxantin (V),
anteraxantin (A) a zeaxantin (Z): pigmenty, které se účastní
xantofylového cyklu;
violaxantin, zeaxantin: oxidační produkty karotenů, složky xantofylového cyklu.
vitelogeneze: fáze vývoje vaječných
buněk, kdy dochází k tvorbě žloutku.
v‑SNARE (vesiculare SNAP
receptors; SNAP = soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor
attachment protein): membránové proteiny cytoplasmatických
transportních měchýřků určené pro vazbu t‑SNARE; umožňují měchýřkům rozpoznat
cílové membrány a splynout s nimi.
vylučovače (excluders): forma odolnosti rastlín na
toxické kovy, ktorá súvisí so zabránením vstupu toxických kovov do
bunky.
výsevová
účinnosť
(plating efficiency): číslo v %,
ktoré vyjadruje množstvo deliacich sa bunek alebo v neskoršom štádiu vývoja
mikrokolónií v závislosti na počte protoplastov pri zahájení
kultivácie;
WW domény
proteinů:
oblasti proteinů obsahující dva konzervativní tryptofanové zbytky, které hrají
důležitou úlohu v interakcích protein‑ protein. Existují 2 hlavní a 2
minoritní sku-piny domén WW. Interagují se sekvencemi Pro‑Pro‑X‑Tyr nebo Pro‑ Pro‑Leu‑Pro,
méně často pak se sekvencí polyprolinového motivu se sousedním Arg nebo Lys nebo
se sekvencí fosforylovaného Ser nebo Thr vázaného na Pro
(pSer/Thr‑Pro).
xantofylový
cyklus: cyklus přeměny V→A→Z, který
umožní rostlině, pomocí Z, disipovat nadbytečnou energii, která by jinak
způsobovala fotoinhibici;
xenobiotiká (cudzorodé látky): látky organického
alebo anorganického charakteru, ktoré nie sú prirodzenou zložkou ekosystému.
xeroderma
pigmentosum:
ľudské dedičné ochorenie spôsobené defektom v nukleotidovej excíznej oprave
(globálnej genómovej oprave). Prejavuje sa náchylnosťou na nádorové ochorenia a
neurodegeneratívne poruchy.
Y: v DNA symbol pro
pyrimidinovou bázi.
YAC (yeast artificial chromosome): umělý chromozom kvasinek, který se může
replikovat v lineární formě v genomu Saccharomyces cerevisiae nebo v
plasmidové formě v E. coli a nese
velký inzert klonované DNA.
zacelování
chromozomů
(chromosome healing): stabilizace
terminálních delecí chromozomů syntézou nových telomerových repetic v místě
zlomu pomocí telomerázy.
základní
elektrolyt:
elektricky vodivý roztok, který sám o sobě neobsahuje žádné elektroaktivní ani
povrchově aktivní látky
zhášení (quenching) fluorescence: snížení výtěžku
fluorescence; známe dva hlavní typy zhášení fluorescence: 1. fotochemické
zhášení (PQ, qP): využití absorbované energie ve fotosyntéze;
2.nefotochemické zhášení (NPQ, qN): výdej absorbované energie v
podobě tepla.
zygomorfní květ:
květ s
jednou rovinou souměrnosti.
živná vrstva (feeder layer): podporný vyživovací
systém v kultúre in
vitro;
životní cyklus
(life cycle): pravidelný sled vývojových stadií
jedince během jeho života.